Ministro
Consejo de Dirección
Consejo Técnico Asesor
6 Viceministros *
22 Direcciones Nacionales
Registros Médicos y Estadísticas Sanitarias
Auditoría
Asesoría Jurídica
Cuadros
Ambulatorio
Hospitales
Materno Infantil
Especialidades
Enfermería
Asistencia Social
Estomatología
Epidemiología
Farmacia
Docencia
Investigación y Desarrollo
Economía y Planificación
Contabilidad y Finanzas
Trabajo
Inversiones y Mantenimiento
Servicios Básicos
Relaciones Internacionales
Medicina Natural y Tradicional
La Dirección de Medicina Natural y Tradicional  cumple el encargo de dirigir la estrategia, coordinar las acciones de integración previstas en el Programa, con todas las Direcciones del MINSAP que participan, así como orientar, controlar y evaluar su implementación en todo el territorio nacional.

^* 1 Viceministro Primero y 1 a Cargo de la Ciudad de la Habana

Nivel Nacional

1. Asamblea Nacional, Consejo de Estado y Consejo de Ministros
2. Ministerio de Salud Pública (Nivel Central)
3. Unidades Nacionales

1. Asamblea Provincial del Poder Popular
2. Dirección Provincial de Salud
3. Unidades Provinciales

1. Asamblea Municipal del Poder Popular
2. Dirección Municipal de Salud
3. Unidades Municipales
4. Consejo Popular
5. Area de Salud
6. GBT
7. Médico de la Familia